南京市：
民国十六年（1927年），析江宁县治附近地区及江浦县浦口镇置南京特别市，后改为南京市。
南京之名始于明朝，明洪武元年(1368年)，朱元璋定都应天府，建号南京。
玄武区：
1955年，第一区更名为玄武区，因境内玄武湖而得名。
秦淮区：
1955年，第三区更名为秦淮区，因境内秦淮河而得名。
秦淮河，古称龙藏浦，又名淮水。
《建康实录》卷1：其淮本名龙藏浦，……屈曲不类人功，疑非秦始皇所开。
《建康实录》卷1：其淮本名龙藏浦，……屈曲不类人功，疑非秦始皇所开。
《元和志》卷25上元县：淮水源出县南华山，在丹阳、湖孰两县界，西北流经秣陵、建康二县之间入于江。初，王敦抅乱，王导忧将覆族，使郭璞筮之，曰：淮水绝，王氏灭。’即此淮也。
建邺区：
1955年，第四区更名为建邺区，因西晋时期建邺县而得名。
西晋太康元年(282年)，改建业县为建邺县。
鼓楼区：
1955年，第五区更名为鼓楼区，因境内鼓楼而得名。
浦口区：
1955年，第七区更名为浦口区，因治所古称浦口而得名。
元、明、清，此地称浦子口，清末简称浦口，意为水滨临岸处。
栖霞区：
1955年，第九区更名为栖霞区，因境内栖霞山而得名。
栖霞山，又名摄山、伞山。
《南史·明僧绍传》：南齐明僧绍弟庆符罢任，僧绍遁还摄山，建栖霞寺而居之。山以寺为名。
雨花台区：
1955年，第十区更名为雨花台区，因境内雨花台而得名。
雨花台，又称石子岗、玛瑙岗、聚宝山。
宋《景定建康志》卷22：雨花台在城南三里，据冈阜最高处，俯瞰城闉。考证：旧传梁武帝时有云光法师讲经于此，感天雨赐花，故名。所产五色石子，因艳丽奇特，故称雨花石。
江宁区：
2000年，改江宁县设江宁区。
西晋太康二年(281年)，改临江县始置江宁县，寓意江外无事宁静。
六合区：
2002年，改六合县设六合区。
隋开皇四年(584年)，改尉氏县始置六合县，因境内六合山而得名。
《舆地纪胜》卷38真州：六合山即定山也。其山相接，通谓之六合山。旧名六峰，曰寒山、曰狮山、曰双鸡、曰芙蓉、曰高妙、曰石人。山有三泉：曰虎跑、曰真珠、曰白鼍。……六合县因六合山以为名。
《隋书·地理志》：六合县有六合山。
溧水区：
2013年，改溧水县设溧水区。
隋开皇十八年(598年)，始置溧水县。
《太平寰宇记》昇州溧阳县：溧水西自溧水县界流入。县以溧水为名。
溧水，又名菱水、陵水、濑水、永阳江、九阳江、颍阳江。《汉书·地理志》所谓中江。
《汉书·地理志》溧阳县应劭注：溧水所出南湖也。
高淳区：
2013年，改高淳县设高淳区。
明弘治四年(1491年)，升溧水县高淳镇置高淳县。
北宋时期，始设高淳镇。
《大明一统志》高淳县：本溧水县地，弘治四年割立信等七乡建为县，开治高淳镇，故名。